Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF20Q5VT98 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF20Q5VT98 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF20Q5VT98 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF20Q5VT98 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF20Q5VT98 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF20Q5VT98 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF20Q5VT98 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF20Q5VT98 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF20Q5VT98 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF20Q5VT98 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF20Q5VT98 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF20Q5VT98 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF20Q5VT98 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF20Q5VT98 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF20Q5VT98 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF20Q5VT98 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF20Q5VT98 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF20Q5VT98 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF20Q5VT98 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF20Q5VT98 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF20Q5VT98 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF20Q5VT98 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF20Q5VT98 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF20Q5VT98 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF20Q5VT98 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF20Q5VT98 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF20Q5VT98 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF20Q5VT98 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF20Q5VT98 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF20Q5VT98 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF20Q5VT98 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF20Q5VT98 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF20Q5VT98 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF20Q5VT98 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF20Q5VT98 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF20Q5VT98 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF20Q5VT98 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF20Q5VT98 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRAMEF20Q5VT98 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF20Q5VT98 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF20Q5VT98 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF20Q5VT98 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF20Q5VT98 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF20Q5VT98 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF20Q5VT98 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF20Q5VT98 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF20Q5VT98 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF20Q5VT98 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF20Q5VT98 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF20Q5VT98 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF20Q5VT98 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF20Q5VT98 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF20Q5VT98 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF20Q5VT98 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF20Q5VT98 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF20Q5VT98 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF20Q5VT98 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF20Q5VT98 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF20Q5VT98 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF20Q5VT98 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF20Q5VT98 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF20Q5VT98 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF20Q5VT98 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF20Q5VT98 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF20Q5VT98 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF20Q5VT98 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF20Q5VT98 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF20Q5VT98 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF20Q5VT98 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF20Q5VT98 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF20Q5VT98 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF20Q5VT98 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF20Q5VT98 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF20Q5VT98 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF20Q5VT98 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF20Q5VT98 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF20Q5VT98 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF20Q5VT98 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRAMEF20Q5VT98 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF20Q5VT98 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF20Q5VT98 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF20Q5VT98 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF20Q5VT98 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF20Q5VT98 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF20Q5VT98 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF20Q5VT98 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF20Q5VT98 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF20Q5VT98 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF20Q5VT98 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF20Q5VT98 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF20Q5VT98 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF20Q5VT98 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF20Q5VT98 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF20Q5VT98 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF20Q5VT98 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF20Q5VT98 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF20Q5VT98 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF20Q5VT98 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF20Q5VT98 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms