Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZFYVE27Q5T4F4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZFYVE27Q5T4F4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZFYVE27Q5T4F4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
ZFYVE27Q5T4F4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZFYVE27Q5T4F4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZFYVE27Q5T4F4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ZFYVE27Q5T4F4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ZFYVE27Q5T4F4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZFYVE27Q5T4F4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZFYVE27Q5T4F4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZFYVE27Q5T4F4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZFYVE27Q5T4F4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZFYVE27Q5T4F4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ZFYVE27Q5T4F4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZFYVE27Q5T4F4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZFYVE27Q5T4F4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZFYVE27Q5T4F4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZFYVE27Q5T4F4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZFYVE27Q5T4F4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZFYVE27Q5T4F4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZFYVE27Q5T4F4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZFYVE27Q5T4F4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZFYVE27Q5T4F4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZFYVE27Q5T4F4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZFYVE27Q5T4F4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFYVE27Q5T4F4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFYVE27Q5T4F4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFYVE27Q5T4F4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFYVE27Q5T4F4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZFYVE27Q5T4F4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZFYVE27Q5T4F4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZFYVE27Q5T4F4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ZFYVE27Q5T4F4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZFYVE27Q5T4F4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZFYVE27Q5T4F4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZFYVE27Q5T4F4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFYVE27Q5T4F4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFYVE27Q5T4F4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFYVE27Q5T4F4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFYVE27Q5T4F4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFYVE27Q5T4F4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFYVE27Q5T4F4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFYVE27Q5T4F4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFYVE27Q5T4F4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZFYVE27Q5T4F4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZFYVE27Q5T4F4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZFYVE27Q5T4F4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZFYVE27Q5T4F4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZFYVE27Q5T4F4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ZFYVE27Q5T4F4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZFYVE27Q5T4F4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZFYVE27Q5T4F4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZFYVE27Q5T4F4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZFYVE27Q5T4F4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ZFYVE27Q5T4F4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZFYVE27Q5T4F4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ZFYVE27Q5T4F4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZFYVE27Q5T4F4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZFYVE27Q5T4F4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZFYVE27Q5T4F4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZFYVE27Q5T4F4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZFYVE27Q5T4F4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZFYVE27Q5T4F4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZFYVE27Q5T4F4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZFYVE27Q5T4F4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZFYVE27Q5T4F4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZFYVE27Q5T4F4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZFYVE27Q5T4F4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ZFYVE27Q5T4F4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZFYVE27Q5T4F4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ZFYVE27Q5T4F4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ZFYVE27Q5T4F4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZFYVE27Q5T4F4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZFYVE27Q5T4F4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ZFYVE27Q5T4F4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZFYVE27Q5T4F4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZFYVE27Q5T4F4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZFYVE27Q5T4F4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZFYVE27Q5T4F4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZFYVE27Q5T4F4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZFYVE27Q5T4F4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZFYVE27Q5T4F4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZFYVE27Q5T4F4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZFYVE27Q5T4F4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZFYVE27Q5T4F4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZFYVE27Q5T4F4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZFYVE27Q5T4F4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZFYVE27Q5T4F4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZFYVE27Q5T4F4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZFYVE27Q5T4F4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZFYVE27Q5T4F4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZFYVE27Q5T4F4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZFYVE27Q5T4F4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ZFYVE27Q5T4F4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZFYVE27Q5T4F4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZFYVE27Q5T4F4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZFYVE27Q5T4F4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZFYVE27Q5T4F4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms