Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C1orf220Q5T0J3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C1orf220Q5T0J3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
C1orf220Q5T0J3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C1orf220Q5T0J3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C1orf220Q5T0J3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C1orf220Q5T0J3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C1orf220Q5T0J3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C1orf220Q5T0J3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
C1orf220Q5T0J3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C1orf220Q5T0J3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C1orf220Q5T0J3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C1orf220Q5T0J3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
C1orf220Q5T0J3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C1orf220Q5T0J3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C1orf220Q5T0J3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
C1orf220Q5T0J3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
C1orf220Q5T0J3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
C1orf220Q5T0J3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
C1orf220Q5T0J3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
C1orf220Q5T0J3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
C1orf220Q5T0J3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C1orf220Q5T0J3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
C1orf220Q5T0J3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C1orf220Q5T0J3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
C1orf220Q5T0J3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C1orf220Q5T0J3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
C1orf220Q5T0J3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
C1orf220Q5T0J3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
C1orf220Q5T0J3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
C1orf220Q5T0J3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
C1orf220Q5T0J3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
C1orf220Q5T0J3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
C1orf220Q5T0J3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C1orf220Q5T0J3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
C1orf220Q5T0J3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C1orf220Q5T0J3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C1orf220Q5T0J3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C1orf220Q5T0J3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C1orf220Q5T0J3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C1orf220Q5T0J3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C1orf220Q5T0J3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
C1orf220Q5T0J3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
C1orf220Q5T0J3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
C1orf220Q5T0J3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
C1orf220Q5T0J3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C1orf220Q5T0J3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C1orf220Q5T0J3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
C1orf220Q5T0J3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
C1orf220Q5T0J3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
C1orf220Q5T0J3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C1orf220Q5T0J3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
C1orf220Q5T0J3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
C1orf220Q5T0J3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C1orf220Q5T0J3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C1orf220Q5T0J3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C1orf220Q5T0J3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C1orf220Q5T0J3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C1orf220Q5T0J3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C1orf220Q5T0J3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C1orf220Q5T0J3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C1orf220Q5T0J3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C1orf220Q5T0J3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C1orf220Q5T0J3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C1orf220Q5T0J3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C1orf220Q5T0J3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C1orf220Q5T0J3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C1orf220Q5T0J3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C1orf220Q5T0J3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
C1orf220Q5T0J3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
C1orf220Q5T0J3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
C1orf220Q5T0J3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C1orf220Q5T0J3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
C1orf220Q5T0J3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
C1orf220Q5T0J3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C1orf220Q5T0J3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C1orf220Q5T0J3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
C1orf220Q5T0J3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
C1orf220Q5T0J3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C1orf220Q5T0J3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
C1orf220Q5T0J3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
C1orf220Q5T0J3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
C1orf220Q5T0J3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
C1orf220Q5T0J3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
C1orf220Q5T0J3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
C1orf220Q5T0J3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
C1orf220Q5T0J3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C1orf220Q5T0J3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C1orf220Q5T0J3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C1orf220Q5T0J3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C1orf220Q5T0J3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C1orf220Q5T0J3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
C1orf220Q5T0J3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C1orf220Q5T0J3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C1orf220Q5T0J3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C1orf220Q5T0J3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C1orf220Q5T0J3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C1orf220Q5T0J3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C1orf220Q5T0J3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C1orf220Q5T0J3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms