Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQN1

SNAP47, Synaptosomal-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP47Q5SQN1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNAP47Q5SQN1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNAP47Q5SQN1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNAP47Q5SQN1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNAP47Q5SQN1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNAP47Q5SQN1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNAP47Q5SQN1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNAP47Q5SQN1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAP47Q5SQN1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAP47Q5SQN1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAP47Q5SQN1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAP47Q5SQN1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAP47Q5SQN1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP47Q5SQN1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP47Q5SQN1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP47Q5SQN1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAP47Q5SQN1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAP47Q5SQN1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAP47Q5SQN1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAP47Q5SQN1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP47Q5SQN1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP47Q5SQN1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP47Q5SQN1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP47Q5SQN1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP47Q5SQN1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP47Q5SQN1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP47Q5SQN1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP47Q5SQN1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP47Q5SQN1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP47Q5SQN1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP47Q5SQN1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP47Q5SQN1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP47Q5SQN1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP47Q5SQN1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP47Q5SQN1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP47Q5SQN1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP47Q5SQN1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP47Q5SQN1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP47Q5SQN1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP47Q5SQN1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP47Q5SQN1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP47Q5SQN1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP47Q5SQN1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNAP47Q5SQN1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNAP47Q5SQN1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNAP47Q5SQN1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNAP47Q5SQN1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNAP47Q5SQN1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SNAP47Q5SQN1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNAP47Q5SQN1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNAP47Q5SQN1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNAP47Q5SQN1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNAP47Q5SQN1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAP47Q5SQN1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAP47Q5SQN1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAP47Q5SQN1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAP47Q5SQN1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAP47Q5SQN1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAP47Q5SQN1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAP47Q5SQN1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAP47Q5SQN1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAP47Q5SQN1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAP47Q5SQN1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAP47Q5SQN1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAP47Q5SQN1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNAP47Q5SQN1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNAP47Q5SQN1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNAP47Q5SQN1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNAP47Q5SQN1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SNAP47Q5SQN1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SNAP47Q5SQN1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNAP47Q5SQN1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNAP47Q5SQN1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNAP47Q5SQN1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNAP47Q5SQN1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNAP47Q5SQN1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAP47Q5SQN1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAP47Q5SQN1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP47Q5SQN1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP47Q5SQN1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP47Q5SQN1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP47Q5SQN1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP47Q5SQN1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAP47Q5SQN1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAP47Q5SQN1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAP47Q5SQN1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAP47Q5SQN1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAP47Q5SQN1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAP47Q5SQN1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAP47Q5SQN1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAP47Q5SQN1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP47Q5SQN1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP47Q5SQN1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP47Q5SQN1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNAP47Q5SQN1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNAP47Q5SQN1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAP47Q5SQN1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAP47Q5SQN1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNAP47Q5SQN1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNAP47Q5SQN1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms