Protein–RNA interactions for Protein: Q5M775

SPECC1, Cytospin-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1Q5M775 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPECC1Q5M775 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPECC1Q5M775 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPECC1Q5M775 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPECC1Q5M775 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPECC1Q5M775 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPECC1Q5M775 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPECC1Q5M775 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPECC1Q5M775 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPECC1Q5M775 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPECC1Q5M775 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPECC1Q5M775 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPECC1Q5M775 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPECC1Q5M775 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPECC1Q5M775 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPECC1Q5M775 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPECC1Q5M775 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPECC1Q5M775 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPECC1Q5M775 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPECC1Q5M775 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPECC1Q5M775 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPECC1Q5M775 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPECC1Q5M775 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
SPECC1Q5M775 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPECC1Q5M775 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPECC1Q5M775 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPECC1Q5M775 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPECC1Q5M775 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPECC1Q5M775 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SPECC1Q5M775 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPECC1Q5M775 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPECC1Q5M775 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPECC1Q5M775 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPECC1Q5M775 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPECC1Q5M775 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SPECC1Q5M775 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPECC1Q5M775 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPECC1Q5M775 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPECC1Q5M775 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPECC1Q5M775 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPECC1Q5M775 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPECC1Q5M775 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPECC1Q5M775 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPECC1Q5M775 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPECC1Q5M775 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPECC1Q5M775 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPECC1Q5M775 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPECC1Q5M775 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPECC1Q5M775 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPECC1Q5M775 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPECC1Q5M775 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPECC1Q5M775 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPECC1Q5M775 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SPECC1Q5M775 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPECC1Q5M775 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPECC1Q5M775 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPECC1Q5M775 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPECC1Q5M775 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPECC1Q5M775 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPECC1Q5M775 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPECC1Q5M775 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPECC1Q5M775 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPECC1Q5M775 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SPECC1Q5M775 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPECC1Q5M775 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPECC1Q5M775 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPECC1Q5M775 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPECC1Q5M775 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPECC1Q5M775 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPECC1Q5M775 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPECC1Q5M775 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPECC1Q5M775 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPECC1Q5M775 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPECC1Q5M775 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPECC1Q5M775 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPECC1Q5M775 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPECC1Q5M775 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPECC1Q5M775 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPECC1Q5M775 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPECC1Q5M775 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPECC1Q5M775 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPECC1Q5M775 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPECC1Q5M775 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPECC1Q5M775 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPECC1Q5M775 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPECC1Q5M775 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPECC1Q5M775 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPECC1Q5M775 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPECC1Q5M775 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
SPECC1Q5M775 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SPECC1Q5M775 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPECC1Q5M775 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPECC1Q5M775 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPECC1Q5M775 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPECC1Q5M775 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPECC1Q5M775 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPECC1Q5M775 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPECC1Q5M775 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPECC1Q5M775 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPECC1Q5M775 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1038.9 ms