Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ODF2Q5BJF6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ODF2Q5BJF6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ODF2Q5BJF6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ODF2Q5BJF6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ODF2Q5BJF6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ODF2Q5BJF6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ODF2Q5BJF6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ODF2Q5BJF6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ODF2Q5BJF6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ODF2Q5BJF6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ODF2Q5BJF6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ODF2Q5BJF6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ODF2Q5BJF6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ODF2Q5BJF6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ODF2Q5BJF6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ODF2Q5BJF6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ODF2Q5BJF6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ODF2Q5BJF6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ODF2Q5BJF6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ODF2Q5BJF6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ODF2Q5BJF6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ODF2Q5BJF6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ODF2Q5BJF6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ODF2Q5BJF6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ODF2Q5BJF6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ODF2Q5BJF6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ODF2Q5BJF6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ODF2Q5BJF6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ODF2Q5BJF6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ODF2Q5BJF6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ODF2Q5BJF6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ODF2Q5BJF6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ODF2Q5BJF6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ODF2Q5BJF6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ODF2Q5BJF6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ODF2Q5BJF6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ODF2Q5BJF6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ODF2Q5BJF6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ODF2Q5BJF6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ODF2Q5BJF6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ODF2Q5BJF6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ODF2Q5BJF6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ODF2Q5BJF6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ODF2Q5BJF6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ODF2Q5BJF6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ODF2Q5BJF6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ODF2Q5BJF6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ODF2Q5BJF6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ODF2Q5BJF6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ODF2Q5BJF6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ODF2Q5BJF6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ODF2Q5BJF6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ODF2Q5BJF6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ODF2Q5BJF6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ODF2Q5BJF6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ODF2Q5BJF6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ODF2Q5BJF6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ODF2Q5BJF6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ODF2Q5BJF6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ODF2Q5BJF6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ODF2Q5BJF6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ODF2Q5BJF6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ODF2Q5BJF6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ODF2Q5BJF6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ODF2Q5BJF6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ODF2Q5BJF6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ODF2Q5BJF6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ODF2Q5BJF6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ODF2Q5BJF6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ODF2Q5BJF6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ODF2Q5BJF6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ODF2Q5BJF6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ODF2Q5BJF6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms