Protein–RNA interactions for Protein: Q56P42

PYDC2, Pyrin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC2Q56P42 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PYDC2Q56P42 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PYDC2Q56P42 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYDC2Q56P42 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYDC2Q56P42 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYDC2Q56P42 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYDC2Q56P42 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PYDC2Q56P42 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYDC2Q56P42 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYDC2Q56P42 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYDC2Q56P42 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PYDC2Q56P42 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms