Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ESCO2Q56NI9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ESCO2Q56NI9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ESCO2Q56NI9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ESCO2Q56NI9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ESCO2Q56NI9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ESCO2Q56NI9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ESCO2Q56NI9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ESCO2Q56NI9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ESCO2Q56NI9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ESCO2Q56NI9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ESCO2Q56NI9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ESCO2Q56NI9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ESCO2Q56NI9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ESCO2Q56NI9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ESCO2Q56NI9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ESCO2Q56NI9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ESCO2Q56NI9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ESCO2Q56NI9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ESCO2Q56NI9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ESCO2Q56NI9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ESCO2Q56NI9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ESCO2Q56NI9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ESCO2Q56NI9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ESCO2Q56NI9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ESCO2Q56NI9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ESCO2Q56NI9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ESCO2Q56NI9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ESCO2Q56NI9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ESCO2Q56NI9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ESCO2Q56NI9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ESCO2Q56NI9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ESCO2Q56NI9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ESCO2Q56NI9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ESCO2Q56NI9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ESCO2Q56NI9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ESCO2Q56NI9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ESCO2Q56NI9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ESCO2Q56NI9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ESCO2Q56NI9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ESCO2Q56NI9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ESCO2Q56NI9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ESCO2Q56NI9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ESCO2Q56NI9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ESCO2Q56NI9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ESCO2Q56NI9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ESCO2Q56NI9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ESCO2Q56NI9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ESCO2Q56NI9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms