Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf17Q53FE4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf17Q53FE4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf17Q53FE4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf17Q53FE4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf17Q53FE4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4orf17Q53FE4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4orf17Q53FE4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4orf17Q53FE4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4orf17Q53FE4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4orf17Q53FE4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4orf17Q53FE4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4orf17Q53FE4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4orf17Q53FE4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4orf17Q53FE4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4orf17Q53FE4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4orf17Q53FE4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4orf17Q53FE4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4orf17Q53FE4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4orf17Q53FE4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C4orf17Q53FE4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4orf17Q53FE4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4orf17Q53FE4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4orf17Q53FE4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4orf17Q53FE4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4orf17Q53FE4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4orf17Q53FE4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4orf17Q53FE4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C4orf17Q53FE4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C4orf17Q53FE4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C4orf17Q53FE4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf17Q53FE4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf17Q53FE4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf17Q53FE4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf17Q53FE4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf17Q53FE4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf17Q53FE4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf17Q53FE4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4orf17Q53FE4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4orf17Q53FE4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4orf17Q53FE4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4orf17Q53FE4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4orf17Q53FE4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4orf17Q53FE4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C4orf17Q53FE4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C4orf17Q53FE4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C4orf17Q53FE4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C4orf17Q53FE4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C4orf17Q53FE4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C4orf17Q53FE4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C4orf17Q53FE4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C4orf17Q53FE4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C4orf17Q53FE4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C4orf17Q53FE4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C4orf17Q53FE4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C4orf17Q53FE4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C4orf17Q53FE4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C4orf17Q53FE4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C4orf17Q53FE4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C4orf17Q53FE4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C4orf17Q53FE4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C4orf17Q53FE4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C4orf17Q53FE4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C4orf17Q53FE4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C4orf17Q53FE4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C4orf17Q53FE4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4orf17Q53FE4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4orf17Q53FE4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
C4orf17Q53FE4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C4orf17Q53FE4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C4orf17Q53FE4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C4orf17Q53FE4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4orf17Q53FE4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4orf17Q53FE4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4orf17Q53FE4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4orf17Q53FE4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4orf17Q53FE4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4orf17Q53FE4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4orf17Q53FE4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4orf17Q53FE4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4orf17Q53FE4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4orf17Q53FE4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4orf17Q53FE4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4orf17Q53FE4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4orf17Q53FE4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4orf17Q53FE4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4orf17Q53FE4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C4orf17Q53FE4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C4orf17Q53FE4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C4orf17Q53FE4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C4orf17Q53FE4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C4orf17Q53FE4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C4orf17Q53FE4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C4orf17Q53FE4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms