Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARHGAP29Q52LW3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARHGAP29Q52LW3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARHGAP29Q52LW3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARHGAP29Q52LW3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARHGAP29Q52LW3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
ARHGAP29Q52LW3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ARHGAP29Q52LW3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGAP29Q52LW3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGAP29Q52LW3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGAP29Q52LW3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGAP29Q52LW3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGAP29Q52LW3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGAP29Q52LW3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGAP29Q52LW3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGAP29Q52LW3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGAP29Q52LW3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGAP29Q52LW3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGAP29Q52LW3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGAP29Q52LW3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGAP29Q52LW3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGAP29Q52LW3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGAP29Q52LW3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGAP29Q52LW3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGAP29Q52LW3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGAP29Q52LW3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGAP29Q52LW3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGAP29Q52LW3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGAP29Q52LW3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGAP29Q52LW3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGAP29Q52LW3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGAP29Q52LW3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGAP29Q52LW3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGAP29Q52LW3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGAP29Q52LW3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGAP29Q52LW3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGAP29Q52LW3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGAP29Q52LW3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGAP29Q52LW3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGAP29Q52LW3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ARHGAP29Q52LW3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGAP29Q52LW3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGAP29Q52LW3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGAP29Q52LW3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGAP29Q52LW3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGAP29Q52LW3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGAP29Q52LW3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGAP29Q52LW3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGAP29Q52LW3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGAP29Q52LW3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGAP29Q52LW3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGAP29Q52LW3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGAP29Q52LW3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGAP29Q52LW3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGAP29Q52LW3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGAP29Q52LW3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGAP29Q52LW3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGAP29Q52LW3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGAP29Q52LW3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms