Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRTAP27-1Q3LI81 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRTAP27-1Q3LI81 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRTAP27-1Q3LI81 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KRTAP27-1Q3LI81 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KRTAP27-1Q3LI81 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRTAP27-1Q3LI81 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRTAP27-1Q3LI81 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRTAP27-1Q3LI81 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRTAP27-1Q3LI81 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRTAP27-1Q3LI81 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRTAP27-1Q3LI81 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KRTAP27-1Q3LI81 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRTAP27-1Q3LI81 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRTAP27-1Q3LI81 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRTAP27-1Q3LI81 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRTAP27-1Q3LI81 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRTAP27-1Q3LI81 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRTAP27-1Q3LI81 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRTAP27-1Q3LI81 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRTAP27-1Q3LI81 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRTAP27-1Q3LI81 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KRTAP27-1Q3LI81 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRTAP27-1Q3LI81 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRTAP27-1Q3LI81 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRTAP27-1Q3LI81 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRTAP27-1Q3LI81 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRTAP27-1Q3LI81 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRTAP27-1Q3LI81 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRTAP27-1Q3LI81 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRTAP27-1Q3LI81 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRTAP27-1Q3LI81 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KRTAP27-1Q3LI81 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRTAP27-1Q3LI81 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRTAP27-1Q3LI81 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KRTAP27-1Q3LI81 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRTAP27-1Q3LI81 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRTAP27-1Q3LI81 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRTAP27-1Q3LI81 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRTAP27-1Q3LI81 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRTAP27-1Q3LI81 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRTAP27-1Q3LI81 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRTAP27-1Q3LI81 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRTAP27-1Q3LI81 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRTAP27-1Q3LI81 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRTAP27-1Q3LI81 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRTAP27-1Q3LI81 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRTAP27-1Q3LI81 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRTAP27-1Q3LI81 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRTAP27-1Q3LI81 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRTAP27-1Q3LI81 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KRTAP27-1Q3LI81 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRTAP27-1Q3LI81 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRTAP27-1Q3LI81 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRTAP27-1Q3LI81 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRTAP27-1Q3LI81 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KRTAP27-1Q3LI81 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms