Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTU2Q2VPK5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTU2Q2VPK5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTU2Q2VPK5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTU2Q2VPK5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTU2Q2VPK5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CTU2Q2VPK5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTU2Q2VPK5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTU2Q2VPK5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTU2Q2VPK5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTU2Q2VPK5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTU2Q2VPK5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTU2Q2VPK5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CTU2Q2VPK5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTU2Q2VPK5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTU2Q2VPK5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTU2Q2VPK5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTU2Q2VPK5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTU2Q2VPK5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTU2Q2VPK5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTU2Q2VPK5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTU2Q2VPK5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTU2Q2VPK5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTU2Q2VPK5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CTU2Q2VPK5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTU2Q2VPK5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTU2Q2VPK5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTU2Q2VPK5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTU2Q2VPK5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CTU2Q2VPK5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTU2Q2VPK5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTU2Q2VPK5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTU2Q2VPK5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTU2Q2VPK5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTU2Q2VPK5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTU2Q2VPK5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTU2Q2VPK5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTU2Q2VPK5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTU2Q2VPK5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTU2Q2VPK5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTU2Q2VPK5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTU2Q2VPK5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTU2Q2VPK5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTU2Q2VPK5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTU2Q2VPK5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTU2Q2VPK5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTU2Q2VPK5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTU2Q2VPK5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTU2Q2VPK5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTU2Q2VPK5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTU2Q2VPK5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTU2Q2VPK5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTU2Q2VPK5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTU2Q2VPK5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTU2Q2VPK5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTU2Q2VPK5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTU2Q2VPK5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTU2Q2VPK5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTU2Q2VPK5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTU2Q2VPK5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTU2Q2VPK5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTU2Q2VPK5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTU2Q2VPK5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTU2Q2VPK5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTU2Q2VPK5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTU2Q2VPK5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTU2Q2VPK5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTU2Q2VPK5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTU2Q2VPK5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTU2Q2VPK5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTU2Q2VPK5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTU2Q2VPK5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTU2Q2VPK5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTU2Q2VPK5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTU2Q2VPK5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTU2Q2VPK5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTU2Q2VPK5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTU2Q2VPK5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTU2Q2VPK5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTU2Q2VPK5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTU2Q2VPK5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTU2Q2VPK5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTU2Q2VPK5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTU2Q2VPK5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTU2Q2VPK5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTU2Q2VPK5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTU2Q2VPK5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTU2Q2VPK5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTU2Q2VPK5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTU2Q2VPK5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTU2Q2VPK5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTU2Q2VPK5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTU2Q2VPK5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTU2Q2VPK5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTU2Q2VPK5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTU2Q2VPK5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTU2Q2VPK5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTU2Q2VPK5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTU2Q2VPK5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTU2Q2VPK5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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