Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ISXQ2M1V0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ISXQ2M1V0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ISXQ2M1V0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ISXQ2M1V0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ISXQ2M1V0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ISXQ2M1V0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ISXQ2M1V0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ISXQ2M1V0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ISXQ2M1V0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ISXQ2M1V0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ISXQ2M1V0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ISXQ2M1V0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ISXQ2M1V0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ISXQ2M1V0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ISXQ2M1V0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ISXQ2M1V0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ISXQ2M1V0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ISXQ2M1V0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ISXQ2M1V0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ISXQ2M1V0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ISXQ2M1V0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ISXQ2M1V0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ISXQ2M1V0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ISXQ2M1V0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ISXQ2M1V0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ISXQ2M1V0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ISXQ2M1V0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ISXQ2M1V0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ISXQ2M1V0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ISXQ2M1V0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ISXQ2M1V0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ISXQ2M1V0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ISXQ2M1V0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ISXQ2M1V0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ISXQ2M1V0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ISXQ2M1V0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ISXQ2M1V0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ISXQ2M1V0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ISXQ2M1V0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ISXQ2M1V0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ISXQ2M1V0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ISXQ2M1V0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ISXQ2M1V0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ISXQ2M1V0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ISXQ2M1V0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ISXQ2M1V0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ISXQ2M1V0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ISXQ2M1V0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ISXQ2M1V0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ISXQ2M1V0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ISXQ2M1V0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ISXQ2M1V0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ISXQ2M1V0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ISXQ2M1V0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ISXQ2M1V0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ISXQ2M1V0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ISXQ2M1V0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ISXQ2M1V0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ISXQ2M1V0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ISXQ2M1V0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ISXQ2M1V0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ISXQ2M1V0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ISXQ2M1V0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ISXQ2M1V0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ISXQ2M1V0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ISXQ2M1V0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ISXQ2M1V0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ISXQ2M1V0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ISXQ2M1V0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ISXQ2M1V0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ISXQ2M1V0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ISXQ2M1V0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ISXQ2M1V0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ISXQ2M1V0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ISXQ2M1V0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ISXQ2M1V0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ISXQ2M1V0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ISXQ2M1V0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ISXQ2M1V0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ISXQ2M1V0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ISXQ2M1V0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ISXQ2M1V0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ISXQ2M1V0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ISXQ2M1V0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ISXQ2M1V0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ISXQ2M1V0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ISXQ2M1V0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ISXQ2M1V0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ISXQ2M1V0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ISXQ2M1V0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ISXQ2M1V0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ISXQ2M1V0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ISXQ2M1V0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ISXQ2M1V0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ISXQ2M1V0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ISXQ2M1V0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ISXQ2M1V0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ISXQ2M1V0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ISXQ2M1V0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.9 ms