Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRRQ15256 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRRQ15256 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRRQ15256 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRRQ15256 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRRQ15256 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRRQ15256 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRRQ15256 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRRQ15256 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRRQ15256 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRRQ15256 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRRQ15256 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRRQ15256 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRRQ15256 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRRQ15256 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRRQ15256 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRRQ15256 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRRQ15256 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRRQ15256 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRRQ15256 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRRQ15256 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRRQ15256 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRRQ15256 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRRQ15256 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRRQ15256 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRRQ15256 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRRQ15256 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRRQ15256 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRRQ15256 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRRQ15256 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRRQ15256 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRRQ15256 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRRQ15256 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRRQ15256 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRRQ15256 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRRQ15256 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRRQ15256 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRRQ15256 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRRQ15256 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRRQ15256 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRRQ15256 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRRQ15256 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRRQ15256 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRRQ15256 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRRQ15256 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRRQ15256 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRRQ15256 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRRQ15256 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRRQ15256 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRRQ15256 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRRQ15256 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRRQ15256 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRRQ15256 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRRQ15256 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRRQ15256 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRRQ15256 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRRQ15256 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRRQ15256 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRRQ15256 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRRQ15256 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRRQ15256 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRRQ15256 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRRQ15256 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRRQ15256 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRRQ15256 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRRQ15256 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRRQ15256 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRRQ15256 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRRQ15256 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRRQ15256 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRRQ15256 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRRQ15256 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRRQ15256 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRRQ15256 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRRQ15256 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRRQ15256 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRRQ15256 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRRQ15256 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRRQ15256 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRRQ15256 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRRQ15256 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
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