Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUNX2Q13950 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNX2Q13950 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNX2Q13950 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNX2Q13950 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNX2Q13950 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNX2Q13950 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNX2Q13950 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNX2Q13950 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNX2Q13950 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNX2Q13950 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNX2Q13950 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNX2Q13950 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNX2Q13950 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNX2Q13950 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNX2Q13950 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNX2Q13950 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNX2Q13950 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNX2Q13950 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNX2Q13950 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNX2Q13950 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNX2Q13950 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNX2Q13950 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNX2Q13950 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNX2Q13950 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNX2Q13950 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNX2Q13950 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNX2Q13950 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNX2Q13950 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNX2Q13950 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNX2Q13950 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNX2Q13950 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNX2Q13950 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNX2Q13950 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNX2Q13950 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNX2Q13950 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNX2Q13950 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNX2Q13950 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNX2Q13950 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNX2Q13950 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNX2Q13950 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNX2Q13950 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNX2Q13950 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNX2Q13950 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNX2Q13950 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNX2Q13950 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNX2Q13950 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNX2Q13950 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNX2Q13950 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNX2Q13950 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNX2Q13950 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNX2Q13950 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNX2Q13950 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNX2Q13950 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNX2Q13950 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNX2Q13950 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNX2Q13950 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNX2Q13950 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNX2Q13950 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNX2Q13950 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNX2Q13950 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNX2Q13950 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNX2Q13950 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNX2Q13950 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNX2Q13950 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNX2Q13950 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNX2Q13950 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNX2Q13950 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNX2Q13950 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNX2Q13950 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNX2Q13950 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNX2Q13950 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNX2Q13950 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNX2Q13950 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RUNX2Q13950 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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