Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH18Q13634 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH18Q13634 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH18Q13634 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH18Q13634 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH18Q13634 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH18Q13634 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH18Q13634 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH18Q13634 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH18Q13634 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH18Q13634 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH18Q13634 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH18Q13634 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH18Q13634 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH18Q13634 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH18Q13634 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH18Q13634 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH18Q13634 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH18Q13634 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH18Q13634 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH18Q13634 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH18Q13634 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH18Q13634 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH18Q13634 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH18Q13634 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH18Q13634 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH18Q13634 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH18Q13634 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH18Q13634 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH18Q13634 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH18Q13634 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH18Q13634 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH18Q13634 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH18Q13634 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH18Q13634 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH18Q13634 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH18Q13634 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH18Q13634 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH18Q13634 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH18Q13634 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH18Q13634 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH18Q13634 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH18Q13634 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH18Q13634 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH18Q13634 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH18Q13634 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH18Q13634 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH18Q13634 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH18Q13634 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH18Q13634 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH18Q13634 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH18Q13634 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDH18Q13634 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDH18Q13634 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDH18Q13634 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDH18Q13634 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CDH18Q13634 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDH18Q13634 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDH18Q13634 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDH18Q13634 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH18Q13634 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH18Q13634 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH18Q13634 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH18Q13634 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH18Q13634 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH18Q13634 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH18Q13634 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH18Q13634 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH18Q13634 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH18Q13634 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH18Q13634 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH18Q13634 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH18Q13634 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH18Q13634 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH18Q13634 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH18Q13634 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH18Q13634 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH18Q13634 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH18Q13634 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH18Q13634 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH18Q13634 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH18Q13634 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH18Q13634 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH18Q13634 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH18Q13634 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH18Q13634 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH18Q13634 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH18Q13634 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH18Q13634 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH18Q13634 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDH18Q13634 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH18Q13634 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH18Q13634 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH18Q13634 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH18Q13634 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH18Q13634 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH18Q13634 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH18Q13634 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH18Q13634 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH18Q13634 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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