Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFX1Q12986 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFX1Q12986 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFX1Q12986 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NFX1Q12986 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NFX1Q12986 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFX1Q12986 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFX1Q12986 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFX1Q12986 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFX1Q12986 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFX1Q12986 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFX1Q12986 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NFX1Q12986 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFX1Q12986 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFX1Q12986 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFX1Q12986 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFX1Q12986 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFX1Q12986 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFX1Q12986 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFX1Q12986 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFX1Q12986 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NFX1Q12986 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFX1Q12986 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFX1Q12986 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFX1Q12986 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFX1Q12986 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFX1Q12986 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFX1Q12986 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFX1Q12986 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NFX1Q12986 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NFX1Q12986 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NFX1Q12986 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFX1Q12986 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NFX1Q12986 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFX1Q12986 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFX1Q12986 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFX1Q12986 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NFX1Q12986 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NFX1Q12986 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NFX1Q12986 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NFX1Q12986 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NFX1Q12986 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFX1Q12986 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFX1Q12986 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFX1Q12986 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFX1Q12986 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFX1Q12986 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NFX1Q12986 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NFX1Q12986 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NFX1Q12986 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NFX1Q12986 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NFX1Q12986 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NFX1Q12986 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NFX1Q12986 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NFX1Q12986 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NFX1Q12986 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NFX1Q12986 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NFX1Q12986 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFX1Q12986 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFX1Q12986 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFX1Q12986 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFX1Q12986 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NFX1Q12986 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFX1Q12986 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFX1Q12986 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NFX1Q12986 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFX1Q12986 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFX1Q12986 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFX1Q12986 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFX1Q12986 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFX1Q12986 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NFX1Q12986 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NFX1Q12986 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NFX1Q12986 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NFX1Q12986 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFX1Q12986 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFX1Q12986 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFX1Q12986 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFX1Q12986 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFX1Q12986 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFX1Q12986 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFX1Q12986 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NFX1Q12986 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NFX1Q12986 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NFX1Q12986 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NFX1Q12986 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NFX1Q12986 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NFX1Q12986 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NFX1Q12986 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NFX1Q12986 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NFX1Q12986 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NFX1Q12986 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NFX1Q12986 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NFX1Q12986 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NFX1Q12986 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFX1Q12986 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFX1Q12986 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFX1Q12986 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NFX1Q12986 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFX1Q12986 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
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