Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNA1Q09470 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNA1Q09470 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNA1Q09470 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNA1Q09470 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNA1Q09470 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
KCNA1Q09470 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
KCNA1Q09470 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
KCNA1Q09470 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCNA1Q09470 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNA1Q09470 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNA1Q09470 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNA1Q09470 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNA1Q09470 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNA1Q09470 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNA1Q09470 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNA1Q09470 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNA1Q09470 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNA1Q09470 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNA1Q09470 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNA1Q09470 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNA1Q09470 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNA1Q09470 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNA1Q09470 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNA1Q09470 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNA1Q09470 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNA1Q09470 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNA1Q09470 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNA1Q09470 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNA1Q09470 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNA1Q09470 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNA1Q09470 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNA1Q09470 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNA1Q09470 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNA1Q09470 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNA1Q09470 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNA1Q09470 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNA1Q09470 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNA1Q09470 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNA1Q09470 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNA1Q09470 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNA1Q09470 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNA1Q09470 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNA1Q09470 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNA1Q09470 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNA1Q09470 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNA1Q09470 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNA1Q09470 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNA1Q09470 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNA1Q09470 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCNA1Q09470 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCNA1Q09470 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCNA1Q09470 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCNA1Q09470 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNA1Q09470 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNA1Q09470 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNA1Q09470 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNA1Q09470 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNA1Q09470 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNA1Q09470 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNA1Q09470 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNA1Q09470 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNA1Q09470 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNA1Q09470 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNA1Q09470 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNA1Q09470 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNA1Q09470 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNA1Q09470 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNA1Q09470 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNA1Q09470 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNA1Q09470 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNA1Q09470 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNA1Q09470 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNA1Q09470 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNA1Q09470 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNA1Q09470 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNA1Q09470 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNA1Q09470 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNA1Q09470 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNA1Q09470 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNA1Q09470 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNA1Q09470 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNA1Q09470 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNA1Q09470 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNA1Q09470 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNA1Q09470 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNA1Q09470 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNA1Q09470 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNA1Q09470 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNA1Q09470 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNA1Q09470 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNA1Q09470 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNA1Q09470 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNA1Q09470 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNA1Q09470 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNA1Q09470 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNA1Q09470 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNA1Q09470 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNA1Q09470 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KCNA1Q09470 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms