Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN11Q06124 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN11Q06124 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN11Q06124 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN11Q06124 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN11Q06124 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN11Q06124 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN11Q06124 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN11Q06124 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN11Q06124 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN11Q06124 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN11Q06124 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN11Q06124 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN11Q06124 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPN11Q06124 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPN11Q06124 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPN11Q06124 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPN11Q06124 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPN11Q06124 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPN11Q06124 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPN11Q06124 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPN11Q06124 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPN11Q06124 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPN11Q06124 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPN11Q06124 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPN11Q06124 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPN11Q06124 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPN11Q06124 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPN11Q06124 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPN11Q06124 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPN11Q06124 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPN11Q06124 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPN11Q06124 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPN11Q06124 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPN11Q06124 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPN11Q06124 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN11Q06124 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN11Q06124 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN11Q06124 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN11Q06124 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN11Q06124 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN11Q06124 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN11Q06124 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN11Q06124 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN11Q06124 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN11Q06124 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPN11Q06124 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPN11Q06124 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN11Q06124 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN11Q06124 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPN11Q06124 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPN11Q06124 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPN11Q06124 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPN11Q06124 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPN11Q06124 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN11Q06124 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN11Q06124 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN11Q06124 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPN11Q06124 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPN11Q06124 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPN11Q06124 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPN11Q06124 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN11Q06124 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN11Q06124 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN11Q06124 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN11Q06124 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPN11Q06124 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPN11Q06124 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN11Q06124 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN11Q06124 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN11Q06124 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN11Q06124 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN11Q06124 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN11Q06124 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN11Q06124 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN11Q06124 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN11Q06124 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN11Q06124 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN11Q06124 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN11Q06124 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN11Q06124 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN11Q06124 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN11Q06124 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN11Q06124 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN11Q06124 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN11Q06124 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN11Q06124 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN11Q06124 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN11Q06124 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN11Q06124 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN11Q06124 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPN11Q06124 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPN11Q06124 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPN11Q06124 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPN11Q06124 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN11Q06124 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN11Q06124 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN11Q06124 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN11Q06124 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN11Q06124 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms