Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPN12Q05209 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPN12Q05209 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPN12Q05209 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPN12Q05209 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPN12Q05209 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPN12Q05209 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPN12Q05209 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPN12Q05209 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPN12Q05209 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPN12Q05209 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPN12Q05209 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPN12Q05209 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPN12Q05209 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPN12Q05209 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPN12Q05209 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PTPN12Q05209 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPN12Q05209 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPN12Q05209 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPN12Q05209 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPN12Q05209 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPN12Q05209 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPN12Q05209 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPN12Q05209 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPN12Q05209 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPN12Q05209 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPN12Q05209 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPN12Q05209 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPN12Q05209 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPN12Q05209 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPN12Q05209 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPN12Q05209 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPN12Q05209 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPN12Q05209 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPN12Q05209 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPN12Q05209 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPN12Q05209 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPN12Q05209 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPN12Q05209 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPN12Q05209 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPN12Q05209 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPN12Q05209 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPN12Q05209 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPN12Q05209 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTPN12Q05209 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTPN12Q05209 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTPN12Q05209 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPN12Q05209 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPN12Q05209 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPN12Q05209 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPN12Q05209 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPN12Q05209 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPN12Q05209 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPN12Q05209 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPN12Q05209 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPN12Q05209 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPN12Q05209 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPN12Q05209 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPN12Q05209 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPN12Q05209 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPN12Q05209 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPN12Q05209 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPN12Q05209 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPN12Q05209 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPN12Q05209 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPN12Q05209 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPN12Q05209 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPN12Q05209 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPN12Q05209 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPN12Q05209 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPN12Q05209 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPN12Q05209 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPN12Q05209 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPN12Q05209 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPN12Q05209 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPN12Q05209 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPN12Q05209 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPN12Q05209 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPN12Q05209 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPN12Q05209 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPN12Q05209 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPN12Q05209 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPN12Q05209 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPN12Q05209 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPN12Q05209 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPN12Q05209 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPN12Q05209 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPN12Q05209 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPN12Q05209 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPN12Q05209 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPN12Q05209 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPN12Q05209 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPN12Q05209 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPN12Q05209 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPN12Q05209 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPN12Q05209 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPN12Q05209 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPN12Q05209 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPN12Q05209 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPN12Q05209 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms