Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACVR1Q04771 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACVR1Q04771 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACVR1Q04771 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACVR1Q04771 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACVR1Q04771 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACVR1Q04771 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACVR1Q04771 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACVR1Q04771 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACVR1Q04771 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACVR1Q04771 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACVR1Q04771 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ACVR1Q04771 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACVR1Q04771 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACVR1Q04771 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACVR1Q04771 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACVR1Q04771 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACVR1Q04771 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACVR1Q04771 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACVR1Q04771 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACVR1Q04771 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACVR1Q04771 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACVR1Q04771 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACVR1Q04771 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACVR1Q04771 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACVR1Q04771 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACVR1Q04771 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACVR1Q04771 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ACVR1Q04771 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACVR1Q04771 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACVR1Q04771 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACVR1Q04771 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACVR1Q04771 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACVR1Q04771 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACVR1Q04771 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACVR1Q04771 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACVR1Q04771 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACVR1Q04771 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACVR1Q04771 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACVR1Q04771 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACVR1Q04771 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACVR1Q04771 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACVR1Q04771 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ACVR1Q04771 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACVR1Q04771 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACVR1Q04771 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ACVR1Q04771 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACVR1Q04771 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACVR1Q04771 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACVR1Q04771 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACVR1Q04771 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACVR1Q04771 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACVR1Q04771 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACVR1Q04771 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACVR1Q04771 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACVR1Q04771 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACVR1Q04771 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACVR1Q04771 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACVR1Q04771 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACVR1Q04771 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ACVR1Q04771 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ACVR1Q04771 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACVR1Q04771 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACVR1Q04771 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACVR1Q04771 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACVR1Q04771 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACVR1Q04771 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACVR1Q04771 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ACVR1Q04771 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACVR1Q04771 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACVR1Q04771 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACVR1Q04771 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACVR1Q04771 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACVR1Q04771 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACVR1Q04771 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ACVR1Q04771 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ACVR1Q04771 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACVR1Q04771 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACVR1Q04771 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACVR1Q04771 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACVR1Q04771 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACVR1Q04771 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACVR1Q04771 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACVR1Q04771 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACVR1Q04771 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACVR1Q04771 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACVR1Q04771 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACVR1Q04771 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACVR1Q04771 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACVR1Q04771 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACVR1Q04771 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACVR1Q04771 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACVR1Q04771 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACVR1Q04771 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACVR1Q04771 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACVR1Q04771 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACVR1Q04771 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACVR1Q04771 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ACVR1Q04771 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACVR1Q04771 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms