Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPL6Q02878 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPL6Q02878 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPL6Q02878 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPL6Q02878 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPL6Q02878 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPL6Q02878 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RPL6Q02878 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RPL6Q02878 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPL6Q02878 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPL6Q02878 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPL6Q02878 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPL6Q02878 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPL6Q02878 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPL6Q02878 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPL6Q02878 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPL6Q02878 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPL6Q02878 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPL6Q02878 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPL6Q02878 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPL6Q02878 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPL6Q02878 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPL6Q02878 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPL6Q02878 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RPL6Q02878 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPL6Q02878 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPL6Q02878 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPL6Q02878 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPL6Q02878 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPL6Q02878 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPL6Q02878 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPL6Q02878 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPL6Q02878 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPL6Q02878 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPL6Q02878 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPL6Q02878 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPL6Q02878 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPL6Q02878 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPL6Q02878 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RPL6Q02878 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RPL6Q02878 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPL6Q02878 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPL6Q02878 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPL6Q02878 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPL6Q02878 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPL6Q02878 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPL6Q02878 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPL6Q02878 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPL6Q02878 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPL6Q02878 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPL6Q02878 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPL6Q02878 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPL6Q02878 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RPL6Q02878 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPL6Q02878 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RPL6Q02878 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPL6Q02878 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPL6Q02878 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPL6Q02878 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPL6Q02878 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms