Protein–RNA interactions for Protein: Q01113

IL9R, Interleukin-9 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL9RQ01113 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IL9RQ01113 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IL9RQ01113 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IL9RQ01113 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IL9RQ01113 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IL9RQ01113 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IL9RQ01113 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IL9RQ01113 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IL9RQ01113 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IL9RQ01113 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IL9RQ01113 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IL9RQ01113 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IL9RQ01113 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IL9RQ01113 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IL9RQ01113 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IL9RQ01113 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IL9RQ01113 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IL9RQ01113 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IL9RQ01113 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IL9RQ01113 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IL9RQ01113 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IL9RQ01113 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
IL9RQ01113 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IL9RQ01113 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IL9RQ01113 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IL9RQ01113 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IL9RQ01113 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IL9RQ01113 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IL9RQ01113 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IL9RQ01113 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IL9RQ01113 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IL9RQ01113 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IL9RQ01113 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IL9RQ01113 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IL9RQ01113 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
IL9RQ01113 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IL9RQ01113 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IL9RQ01113 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
IL9RQ01113 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IL9RQ01113 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IL9RQ01113 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IL9RQ01113 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IL9RQ01113 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IL9RQ01113 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IL9RQ01113 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IL9RQ01113 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IL9RQ01113 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
IL9RQ01113 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IL9RQ01113 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IL9RQ01113 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IL9RQ01113 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IL9RQ01113 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
IL9RQ01113 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IL9RQ01113 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IL9RQ01113 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IL9RQ01113 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
IL9RQ01113 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IL9RQ01113 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IL9RQ01113 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IL9RQ01113 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IL9RQ01113 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IL9RQ01113 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IL9RQ01113 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
IL9RQ01113 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IL9RQ01113 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IL9RQ01113 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IL9RQ01113 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IL9RQ01113 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IL9RQ01113 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IL9RQ01113 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IL9RQ01113 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IL9RQ01113 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IL9RQ01113 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IL9RQ01113 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IL9RQ01113 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IL9RQ01113 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IL9RQ01113 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IL9RQ01113 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IL9RQ01113 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IL9RQ01113 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IL9RQ01113 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IL9RQ01113 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
IL9RQ01113 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IL9RQ01113 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IL9RQ01113 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IL9RQ01113 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IL9RQ01113 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IL9RQ01113 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IL9RQ01113 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IL9RQ01113 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IL9RQ01113 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
IL9RQ01113 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IL9RQ01113 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IL9RQ01113 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IL9RQ01113 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IL9RQ01113 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IL9RQ01113 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IL9RQ01113 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IL9RQ01113 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IL9RQ01113 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms