Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSF1Q00613 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSF1Q00613 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSF1Q00613 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSF1Q00613 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSF1Q00613 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSF1Q00613 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSF1Q00613 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HSF1Q00613 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSF1Q00613 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSF1Q00613 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSF1Q00613 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSF1Q00613 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSF1Q00613 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSF1Q00613 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSF1Q00613 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSF1Q00613 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSF1Q00613 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSF1Q00613 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSF1Q00613 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSF1Q00613 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSF1Q00613 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSF1Q00613 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSF1Q00613 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSF1Q00613 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HSF1Q00613 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HSF1Q00613 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSF1Q00613 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSF1Q00613 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSF1Q00613 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSF1Q00613 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HSF1Q00613 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSF1Q00613 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.8 ms