Protein–RNA interactions for Protein: P86397

HTD2, Hydroxyacyl-thioester dehydratase type 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTD2P86397 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTD2P86397 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTD2P86397 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTD2P86397 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTD2P86397 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTD2P86397 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTD2P86397 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTD2P86397 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HTD2P86397 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HTD2P86397 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HTD2P86397 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HTD2P86397 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HTD2P86397 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HTD2P86397 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HTD2P86397 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HTD2P86397 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HTD2P86397 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HTD2P86397 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HTD2P86397 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HTD2P86397 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HTD2P86397 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HTD2P86397 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HTD2P86397 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HTD2P86397 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HTD2P86397 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HTD2P86397 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HTD2P86397 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HTD2P86397 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HTD2P86397 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HTD2P86397 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HTD2P86397 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HTD2P86397 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HTD2P86397 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HTD2P86397 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HTD2P86397 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HTD2P86397 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HTD2P86397 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HTD2P86397 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HTD2P86397 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HTD2P86397 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HTD2P86397 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HTD2P86397 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HTD2P86397 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HTD2P86397 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HTD2P86397 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HTD2P86397 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HTD2P86397 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HTD2P86397 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HTD2P86397 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HTD2P86397 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HTD2P86397 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HTD2P86397 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTD2P86397 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTD2P86397 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTD2P86397 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HTD2P86397 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTD2P86397 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTD2P86397 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTD2P86397 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTD2P86397 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HTD2P86397 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HTD2P86397 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTD2P86397 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTD2P86397 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTD2P86397 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTD2P86397 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTD2P86397 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTD2P86397 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTD2P86397 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTD2P86397 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTD2P86397 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTD2P86397 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTD2P86397 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTD2P86397 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTD2P86397 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTD2P86397 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTD2P86397 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTD2P86397 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTD2P86397 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTD2P86397 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTD2P86397 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTD2P86397 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTD2P86397 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HTD2P86397 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTD2P86397 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTD2P86397 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HTD2P86397 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HTD2P86397 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HTD2P86397 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HTD2P86397 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HTD2P86397 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HTD2P86397 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HTD2P86397 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HTD2P86397 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HTD2P86397 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HTD2P86397 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HTD2P86397 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HTD2P86397 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HTD2P86397 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HTD2P86397 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms