Protein–RNA interactions for Protein: P61601

NCALD, Neurocalcin-delta, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCALDP61601 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCALDP61601 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCALDP61601 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCALDP61601 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCALDP61601 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCALDP61601 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCALDP61601 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCALDP61601 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCALDP61601 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCALDP61601 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCALDP61601 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCALDP61601 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCALDP61601 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCALDP61601 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCALDP61601 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCALDP61601 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NCALDP61601 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCALDP61601 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCALDP61601 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCALDP61601 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCALDP61601 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCALDP61601 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCALDP61601 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCALDP61601 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NCALDP61601 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCALDP61601 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCALDP61601 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCALDP61601 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCALDP61601 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCALDP61601 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCALDP61601 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCALDP61601 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCALDP61601 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCALDP61601 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCALDP61601 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCALDP61601 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NCALDP61601 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCALDP61601 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NCALDP61601 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NCALDP61601 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NCALDP61601 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCALDP61601 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCALDP61601 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCALDP61601 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCALDP61601 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCALDP61601 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCALDP61601 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCALDP61601 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NCALDP61601 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCALDP61601 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCALDP61601 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCALDP61601 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCALDP61601 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCALDP61601 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCALDP61601 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCALDP61601 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCALDP61601 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCALDP61601 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCALDP61601 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCALDP61601 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCALDP61601 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCALDP61601 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCALDP61601 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCALDP61601 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCALDP61601 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCALDP61601 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCALDP61601 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCALDP61601 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCALDP61601 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCALDP61601 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCALDP61601 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCALDP61601 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCALDP61601 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCALDP61601 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCALDP61601 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCALDP61601 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCALDP61601 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NCALDP61601 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCALDP61601 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NCALDP61601 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NCALDP61601 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCALDP61601 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCALDP61601 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCALDP61601 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCALDP61601 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCALDP61601 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCALDP61601 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCALDP61601 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCALDP61601 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCALDP61601 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCALDP61601 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCALDP61601 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCALDP61601 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCALDP61601 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCALDP61601 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NCALDP61601 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NCALDP61601 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NCALDP61601 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCALDP61601 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCALDP61601 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms