Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVS71-1P61550 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVS71-1P61550 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVS71-1P61550 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVS71-1P61550 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVS71-1P61550 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVS71-1P61550 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVS71-1P61550 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVS71-1P61550 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVS71-1P61550 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVS71-1P61550 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVS71-1P61550 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVS71-1P61550 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVS71-1P61550 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVS71-1P61550 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVS71-1P61550 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVS71-1P61550 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVS71-1P61550 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVS71-1P61550 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVS71-1P61550 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVS71-1P61550 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVS71-1P61550 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVS71-1P61550 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVS71-1P61550 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVS71-1P61550 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVS71-1P61550 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVS71-1P61550 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVS71-1P61550 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVS71-1P61550 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVS71-1P61550 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVS71-1P61550 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVS71-1P61550 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVS71-1P61550 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVS71-1P61550 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVS71-1P61550 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVS71-1P61550 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVS71-1P61550 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVS71-1P61550 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVS71-1P61550 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVS71-1P61550 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVS71-1P61550 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVS71-1P61550 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVS71-1P61550 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVS71-1P61550 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVS71-1P61550 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVS71-1P61550 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVS71-1P61550 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVS71-1P61550 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVS71-1P61550 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVS71-1P61550 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVS71-1P61550 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVS71-1P61550 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVS71-1P61550 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVS71-1P61550 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
ERVS71-1P61550 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVS71-1P61550 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVS71-1P61550 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVS71-1P61550 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVS71-1P61550 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVS71-1P61550 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVS71-1P61550 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVS71-1P61550 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVS71-1P61550 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVS71-1P61550 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVS71-1P61550 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVS71-1P61550 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVS71-1P61550 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVS71-1P61550 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVS71-1P61550 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVS71-1P61550 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVS71-1P61550 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVS71-1P61550 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVS71-1P61550 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVS71-1P61550 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVS71-1P61550 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVS71-1P61550 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVS71-1P61550 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVS71-1P61550 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVS71-1P61550 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVS71-1P61550 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVS71-1P61550 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVS71-1P61550 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVS71-1P61550 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVS71-1P61550 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVS71-1P61550 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVS71-1P61550 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVS71-1P61550 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVS71-1P61550 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVS71-1P61550 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVS71-1P61550 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms