Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCDC1P59894 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCDC1P59894 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCDC1P59894 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCDC1P59894 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCDC1P59894 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCDC1P59894 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCDC1P59894 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCDC1P59894 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DCDC1P59894 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCDC1P59894 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCDC1P59894 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCDC1P59894 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCDC1P59894 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCDC1P59894 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCDC1P59894 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCDC1P59894 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DCDC1P59894 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCDC1P59894 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCDC1P59894 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCDC1P59894 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCDC1P59894 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCDC1P59894 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCDC1P59894 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCDC1P59894 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCDC1P59894 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCDC1P59894 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DCDC1P59894 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCDC1P59894 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCDC1P59894 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCDC1P59894 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCDC1P59894 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCDC1P59894 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCDC1P59894 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCDC1P59894 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCDC1P59894 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCDC1P59894 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCDC1P59894 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCDC1P59894 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCDC1P59894 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCDC1P59894 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCDC1P59894 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCDC1P59894 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCDC1P59894 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DCDC1P59894 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCDC1P59894 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCDC1P59894 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCDC1P59894 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCDC1P59894 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCDC1P59894 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCDC1P59894 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCDC1P59894 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DCDC1P59894 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCDC1P59894 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCDC1P59894 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCDC1P59894 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCDC1P59894 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCDC1P59894 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCDC1P59894 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCDC1P59894 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCDC1P59894 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCDC1P59894 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DCDC1P59894 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DCDC1P59894 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCDC1P59894 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCDC1P59894 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCDC1P59894 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCDC1P59894 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCDC1P59894 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCDC1P59894 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCDC1P59894 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCDC1P59894 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCDC1P59894 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCDC1P59894 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCDC1P59894 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCDC1P59894 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCDC1P59894 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCDC1P59894 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DCDC1P59894 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCDC1P59894 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCDC1P59894 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCDC1P59894 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCDC1P59894 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCDC1P59894 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCDC1P59894 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCDC1P59894 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCDC1P59894 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCDC1P59894 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCDC1P59894 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCDC1P59894 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCDC1P59894 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCDC1P59894 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCDC1P59894 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCDC1P59894 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCDC1P59894 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCDC1P59894 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCDC1P59894 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCDC1P59894 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCDC1P59894 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCDC1P59894 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms