Protein–RNA interactions for Protein: P58743

SLC26A5, Prestin, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A5P58743 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC26A5P58743 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC26A5P58743 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC26A5P58743 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC26A5P58743 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC26A5P58743 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC26A5P58743 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC26A5P58743 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC26A5P58743 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC26A5P58743 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC26A5P58743 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC26A5P58743 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC26A5P58743 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC26A5P58743 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC26A5P58743 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC26A5P58743 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC26A5P58743 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC26A5P58743 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC26A5P58743 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC26A5P58743 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC26A5P58743 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC26A5P58743 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC26A5P58743 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC26A5P58743 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC26A5P58743 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC26A5P58743 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC26A5P58743 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC26A5P58743 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC26A5P58743 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC26A5P58743 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC26A5P58743 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC26A5P58743 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC26A5P58743 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC26A5P58743 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC26A5P58743 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC26A5P58743 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC26A5P58743 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC26A5P58743 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC26A5P58743 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC26A5P58743 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC26A5P58743 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC26A5P58743 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC26A5P58743 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC26A5P58743 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC26A5P58743 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC26A5P58743 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC26A5P58743 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC26A5P58743 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC26A5P58743 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC26A5P58743 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC26A5P58743 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC26A5P58743 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC26A5P58743 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC26A5P58743 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC26A5P58743 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC26A5P58743 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC26A5P58743 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC26A5P58743 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC26A5P58743 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC26A5P58743 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms