Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLCNKBP51801 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLCNKBP51801 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLCNKBP51801 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLCNKBP51801 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLCNKBP51801 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLCNKBP51801 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLCNKBP51801 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLCNKBP51801 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLCNKBP51801 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLCNKBP51801 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLCNKBP51801 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CLCNKBP51801 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLCNKBP51801 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLCNKBP51801 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLCNKBP51801 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLCNKBP51801 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLCNKBP51801 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLCNKBP51801 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLCNKBP51801 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLCNKBP51801 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLCNKBP51801 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLCNKBP51801 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLCNKBP51801 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLCNKBP51801 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CLCNKBP51801 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLCNKBP51801 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLCNKBP51801 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLCNKBP51801 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLCNKBP51801 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLCNKBP51801 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLCNKBP51801 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLCNKBP51801 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLCNKBP51801 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLCNKBP51801 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLCNKBP51801 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLCNKBP51801 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLCNKBP51801 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLCNKBP51801 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLCNKBP51801 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLCNKBP51801 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLCNKBP51801 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CLCNKBP51801 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLCNKBP51801 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLCNKBP51801 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CLCNKBP51801 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CLCNKBP51801 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLCNKBP51801 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLCNKBP51801 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLCNKBP51801 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLCNKBP51801 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLCNKBP51801 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLCNKBP51801 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLCNKBP51801 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLCNKBP51801 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLCNKBP51801 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLCNKBP51801 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLCNKBP51801 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLCNKBP51801 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLCNKBP51801 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLCNKBP51801 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLCNKBP51801 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLCNKBP51801 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CLCNKBP51801 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLCNKBP51801 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLCNKBP51801 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLCNKBP51801 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLCNKBP51801 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLCNKBP51801 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLCNKBP51801 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLCNKBP51801 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLCNKBP51801 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLCNKBP51801 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLCNKBP51801 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLCNKBP51801 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLCNKBP51801 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLCNKBP51801 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLCNKBP51801 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLCNKBP51801 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLCNKBP51801 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLCNKBP51801 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLCNKBP51801 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLCNKBP51801 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLCNKBP51801 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLCNKBP51801 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLCNKBP51801 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLCNKBP51801 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLCNKBP51801 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLCNKBP51801 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLCNKBP51801 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLCNKBP51801 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLCNKBP51801 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLCNKBP51801 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLCNKBP51801 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLCNKBP51801 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLCNKBP51801 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLCNKBP51801 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLCNKBP51801 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLCNKBP51801 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLCNKBP51801 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms