Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARL1P40616 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARL1P40616 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARL1P40616 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARL1P40616 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARL1P40616 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ARL1P40616 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARL1P40616 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARL1P40616 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARL1P40616 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARL1P40616 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARL1P40616 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARL1P40616 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARL1P40616 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARL1P40616 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARL1P40616 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARL1P40616 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ARL1P40616 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ARL1P40616 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARL1P40616 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARL1P40616 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ARL1P40616 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ARL1P40616 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARL1P40616 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARL1P40616 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARL1P40616 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARL1P40616 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARL1P40616 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARL1P40616 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARL1P40616 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARL1P40616 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARL1P40616 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARL1P40616 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARL1P40616 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARL1P40616 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARL1P40616 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARL1P40616 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARL1P40616 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARL1P40616 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARL1P40616 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARL1P40616 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARL1P40616 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARL1P40616 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARL1P40616 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARL1P40616 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARL1P40616 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARL1P40616 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARL1P40616 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARL1P40616 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARL1P40616 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARL1P40616 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARL1P40616 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARL1P40616 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARL1P40616 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARL1P40616 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARL1P40616 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ARL1P40616 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ARL1P40616 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARL1P40616 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARL1P40616 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ARL1P40616 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARL1P40616 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ARL1P40616 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARL1P40616 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARL1P40616 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARL1P40616 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARL1P40616 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARL1P40616 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARL1P40616 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARL1P40616 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARL1P40616 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARL1P40616 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARL1P40616 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARL1P40616 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARL1P40616 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARL1P40616 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARL1P40616 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARL1P40616 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARL1P40616 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARL1P40616 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARL1P40616 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARL1P40616 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARL1P40616 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARL1P40616 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARL1P40616 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARL1P40616 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARL1P40616 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARL1P40616 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARL1P40616 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARL1P40616 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARL1P40616 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARL1P40616 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARL1P40616 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARL1P40616 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARL1P40616 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARL1P40616 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARL1P40616 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARL1P40616 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARL1P40616 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ARL1P40616 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms