Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NTF4P34130 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NTF4P34130 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NTF4P34130 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NTF4P34130 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NTF4P34130 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NTF4P34130 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NTF4P34130 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NTF4P34130 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NTF4P34130 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NTF4P34130 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
NTF4P34130 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NTF4P34130 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NTF4P34130 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NTF4P34130 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NTF4P34130 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NTF4P34130 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NTF4P34130 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NTF4P34130 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NTF4P34130 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NTF4P34130 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTF4P34130 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTF4P34130 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTF4P34130 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTF4P34130 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTF4P34130 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTF4P34130 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTF4P34130 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTF4P34130 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTF4P34130 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NTF4P34130 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NTF4P34130 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NTF4P34130 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTF4P34130 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NTF4P34130 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NTF4P34130 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NTF4P34130 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NTF4P34130 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NTF4P34130 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NTF4P34130 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NTF4P34130 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NTF4P34130 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NTF4P34130 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NTF4P34130 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NTF4P34130 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NTF4P34130 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NTF4P34130 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTF4P34130 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTF4P34130 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTF4P34130 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTF4P34130 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTF4P34130 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTF4P34130 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTF4P34130 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTF4P34130 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTF4P34130 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTF4P34130 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTF4P34130 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTF4P34130 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTF4P34130 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NTF4P34130 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTF4P34130 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTF4P34130 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTF4P34130 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTF4P34130 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTF4P34130 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTF4P34130 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTF4P34130 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTF4P34130 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTF4P34130 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTF4P34130 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTF4P34130 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NTF4P34130 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NTF4P34130 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NTF4P34130 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NTF4P34130 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NTF4P34130 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NTF4P34130 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NTF4P34130 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NTF4P34130 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NTF4P34130 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NTF4P34130 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NTF4P34130 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NTF4P34130 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NTF4P34130 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTF4P34130 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTF4P34130 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTF4P34130 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTF4P34130 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTF4P34130 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NTF4P34130 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NTF4P34130 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NTF4P34130 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NTF4P34130 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NTF4P34130 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NTF4P34130 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NTF4P34130 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NTF4P34130 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NTF4P34130 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NTF4P34130 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms