Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASP1P29466 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASP1P29466 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CASP1P29466 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASP1P29466 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASP1P29466 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASP1P29466 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASP1P29466 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASP1P29466 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASP1P29466 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASP1P29466 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASP1P29466 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASP1P29466 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASP1P29466 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASP1P29466 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASP1P29466 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CASP1P29466 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CASP1P29466 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CASP1P29466 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CASP1P29466 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CASP1P29466 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CASP1P29466 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CASP1P29466 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CASP1P29466 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CASP1P29466 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CASP1P29466 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CASP1P29466 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CASP1P29466 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CASP1P29466 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CASP1P29466 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CASP1P29466 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CASP1P29466 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CASP1P29466 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CASP1P29466 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CASP1P29466 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CASP1P29466 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CASP1P29466 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CASP1P29466 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CASP1P29466 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CASP1P29466 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CASP1P29466 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CASP1P29466 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CASP1P29466 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CASP1P29466 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CASP1P29466 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CASP1P29466 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CASP1P29466 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CASP1P29466 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CASP1P29466 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CASP1P29466 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CASP1P29466 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CASP1P29466 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CASP1P29466 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CASP1P29466 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CASP1P29466 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CASP1P29466 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CASP1P29466 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CASP1P29466 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CASP1P29466 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CASP1P29466 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASP1P29466 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASP1P29466 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CASP1P29466 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASP1P29466 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASP1P29466 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASP1P29466 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CASP1P29466 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CASP1P29466 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CASP1P29466 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CASP1P29466 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CASP1P29466 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CASP1P29466 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASP1P29466 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CASP1P29466 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASP1P29466 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASP1P29466 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASP1P29466 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASP1P29466 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASP1P29466 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASP1P29466 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASP1P29466 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASP1P29466 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASP1P29466 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CASP1P29466 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CASP1P29466 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CASP1P29466 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CASP1P29466 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CASP1P29466 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CASP1P29466 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASP1P29466 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASP1P29466 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CASP1P29466 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CASP1P29466 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CASP1P29466 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CASP1P29466 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CASP1P29466 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASP1P29466 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASP1P29466 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASP1P29466 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASP1P29466 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms