Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR2AP28223 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR2AP28223 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR2AP28223 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR2AP28223 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR2AP28223 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR2AP28223 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR2AP28223 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR2AP28223 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR2AP28223 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR2AP28223 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR2AP28223 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR2AP28223 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR2AP28223 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR2AP28223 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR2AP28223 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR2AP28223 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR2AP28223 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR2AP28223 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR2AP28223 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR2AP28223 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR2AP28223 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HTR2AP28223 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR2AP28223 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms