Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMB5P28074 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMB5P28074 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMB5P28074 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMB5P28074 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMB5P28074 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMB5P28074 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMB5P28074 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMB5P28074 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMB5P28074 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMB5P28074 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMB5P28074 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMB5P28074 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMB5P28074 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMB5P28074 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMB5P28074 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMB5P28074 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMB5P28074 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMB5P28074 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMB5P28074 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMB5P28074 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMB5P28074 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMB5P28074 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMB5P28074 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMB5P28074 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMB5P28074 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMB5P28074 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMB5P28074 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMB5P28074 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMB5P28074 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMB5P28074 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMB5P28074 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMB5P28074 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMB5P28074 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMB5P28074 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMB5P28074 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMB5P28074 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMB5P28074 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMB5P28074 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMB5P28074 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMB5P28074 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMB5P28074 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMB5P28074 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMB5P28074 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMB5P28074 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMB5P28074 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMB5P28074 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMB5P28074 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMB5P28074 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMB5P28074 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMB5P28074 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMB5P28074 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMB5P28074 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMB5P28074 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMB5P28074 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMB5P28074 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMB5P28074 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMB5P28074 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMB5P28074 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMB5P28074 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSMB5P28074 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSMB5P28074 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMB5P28074 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMB5P28074 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMB5P28074 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMB5P28074 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMB5P28074 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMB5P28074 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMB5P28074 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMB5P28074 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMB5P28074 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMB5P28074 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMB5P28074 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMB5P28074 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMB5P28074 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMB5P28074 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMB5P28074 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMB5P28074 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMB5P28074 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMB5P28074 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMB5P28074 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMB5P28074 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMB5P28074 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMB5P28074 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMB5P28074 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMB5P28074 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMB5P28074 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMB5P28074 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMB5P28074 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMB5P28074 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMB5P28074 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMB5P28074 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMB5P28074 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMB5P28074 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMB5P28074 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMB5P28074 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMB5P28074 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMB5P28074 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PSMB5P28074 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PSMB5P28074 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.9 ms