Protein–RNA interactions for Protein: P26373

RPL13, 60S ribosomal protein L13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13P26373 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPL13P26373 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPL13P26373 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPL13P26373 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPL13P26373 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPL13P26373 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPL13P26373 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPL13P26373 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPL13P26373 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPL13P26373 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPL13P26373 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPL13P26373 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPL13P26373 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPL13P26373 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPL13P26373 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPL13P26373 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPL13P26373 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPL13P26373 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPL13P26373 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPL13P26373 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPL13P26373 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPL13P26373 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPL13P26373 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPL13P26373 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPL13P26373 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPL13P26373 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPL13P26373 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPL13P26373 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPL13P26373 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RPL13P26373 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPL13P26373 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPL13P26373 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPL13P26373 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPL13P26373 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPL13P26373 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPL13P26373 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPL13P26373 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPL13P26373 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPL13P26373 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPL13P26373 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPL13P26373 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPL13P26373 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPL13P26373 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPL13P26373 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPL13P26373 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
RPL13P26373 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPL13P26373 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPL13P26373 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPL13P26373 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPL13P26373 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPL13P26373 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPL13P26373 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPL13P26373 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPL13P26373 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPL13P26373 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RPL13P26373 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPL13P26373 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPL13P26373 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPL13P26373 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPL13P26373 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPL13P26373 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPL13P26373 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RPL13P26373 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPL13P26373 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPL13P26373 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPL13P26373 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPL13P26373 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPL13P26373 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPL13P26373 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPL13P26373 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPL13P26373 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPL13P26373 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPL13P26373 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPL13P26373 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPL13P26373 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPL13P26373 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPL13P26373 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPL13P26373 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPL13P26373 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPL13P26373 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPL13P26373 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPL13P26373 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPL13P26373 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPL13P26373 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPL13P26373 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPL13P26373 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPL13P26373 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPL13P26373 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPL13P26373 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPL13P26373 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPL13P26373 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPL13P26373 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPL13P26373 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPL13P26373 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPL13P26373 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPL13P26373 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RPL13P26373 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPL13P26373 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPL13P26373 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPL13P26373 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms