Protein–RNA interactions for Protein: P24468

NR2F2, COUP transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F2P24468 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NR2F2P24468 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NR2F2P24468 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NR2F2P24468 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NR2F2P24468 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NR2F2P24468 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NR2F2P24468 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NR2F2P24468 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NR2F2P24468 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NR2F2P24468 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NR2F2P24468 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NR2F2P24468 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NR2F2P24468 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NR2F2P24468 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NR2F2P24468 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NR2F2P24468 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NR2F2P24468 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NR2F2P24468 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NR2F2P24468 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NR2F2P24468 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NR2F2P24468 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NR2F2P24468 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NR2F2P24468 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NR2F2P24468 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NR2F2P24468 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NR2F2P24468 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NR2F2P24468 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NR2F2P24468 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NR2F2P24468 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NR2F2P24468 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NR2F2P24468 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NR2F2P24468 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NR2F2P24468 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NR2F2P24468 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NR2F2P24468 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NR2F2P24468 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NR2F2P24468 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NR2F2P24468 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NR2F2P24468 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NR2F2P24468 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NR2F2P24468 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NR2F2P24468 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NR2F2P24468 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NR2F2P24468 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NR2F2P24468 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NR2F2P24468 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NR2F2P24468 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NR2F2P24468 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NR2F2P24468 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NR2F2P24468 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NR2F2P24468 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NR2F2P24468 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NR2F2P24468 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NR2F2P24468 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NR2F2P24468 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NR2F2P24468 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NR2F2P24468 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NR2F2P24468 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NR2F2P24468 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NR2F2P24468 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NR2F2P24468 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NR2F2P24468 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NR2F2P24468 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NR2F2P24468 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NR2F2P24468 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
NR2F2P24468 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NR2F2P24468 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NR2F2P24468 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NR2F2P24468 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NR2F2P24468 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NR2F2P24468 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NR2F2P24468 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NR2F2P24468 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NR2F2P24468 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NR2F2P24468 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NR2F2P24468 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NR2F2P24468 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NR2F2P24468 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NR2F2P24468 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NR2F2P24468 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NR2F2P24468 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NR2F2P24468 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NR2F2P24468 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NR2F2P24468 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NR2F2P24468 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NR2F2P24468 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NR2F2P24468 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NR2F2P24468 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NR2F2P24468 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NR2F2P24468 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NR2F2P24468 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NR2F2P24468 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NR2F2P24468 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NR2F2P24468 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NR2F2P24468 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NR2F2P24468 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NR2F2P24468 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NR2F2P24468 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NR2F2P24468 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NR2F2P24468 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.6 ms