Protein–RNA interactions for Protein: P23760

PAX3, Paired box protein Pax-3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX3P23760 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PAX3P23760 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PAX3P23760 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PAX3P23760 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PAX3P23760 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PAX3P23760 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PAX3P23760 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PAX3P23760 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PAX3P23760 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PAX3P23760 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PAX3P23760 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PAX3P23760 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PAX3P23760 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PAX3P23760 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PAX3P23760 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PAX3P23760 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PAX3P23760 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PAX3P23760 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PAX3P23760 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PAX3P23760 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PAX3P23760 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PAX3P23760 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PAX3P23760 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PAX3P23760 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAX3P23760 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAX3P23760 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAX3P23760 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PAX3P23760 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAX3P23760 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAX3P23760 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PAX3P23760 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PAX3P23760 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PAX3P23760 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PAX3P23760 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PAX3P23760 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PAX3P23760 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PAX3P23760 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PAX3P23760 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PAX3P23760 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PAX3P23760 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PAX3P23760 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PAX3P23760 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PAX3P23760 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PAX3P23760 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PAX3P23760 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PAX3P23760 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAX3P23760 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAX3P23760 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAX3P23760 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAX3P23760 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAX3P23760 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PAX3P23760 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAX3P23760 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAX3P23760 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAX3P23760 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAX3P23760 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAX3P23760 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAX3P23760 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAX3P23760 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAX3P23760 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PAX3P23760 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAX3P23760 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAX3P23760 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAX3P23760 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAX3P23760 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAX3P23760 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAX3P23760 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAX3P23760 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAX3P23760 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAX3P23760 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAX3P23760 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAX3P23760 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PAX3P23760 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAX3P23760 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAX3P23760 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAX3P23760 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAX3P23760 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAX3P23760 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAX3P23760 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PAX3P23760 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAX3P23760 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PAX3P23760 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PAX3P23760 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PAX3P23760 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PAX3P23760 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PAX3P23760 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PAX3P23760 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PAX3P23760 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PAX3P23760 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PAX3P23760 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PAX3P23760 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PAX3P23760 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAX3P23760 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAX3P23760 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAX3P23760 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAX3P23760 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAX3P23760 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAX3P23760 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAX3P23760 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PAX3P23760 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms