Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRDP23468 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRDP23468 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRDP23468 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRDP23468 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRDP23468 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRDP23468 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRDP23468 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRDP23468 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRDP23468 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRDP23468 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRDP23468 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRDP23468 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRDP23468 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPRDP23468 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPRDP23468 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPRDP23468 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRDP23468 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRDP23468 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRDP23468 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRDP23468 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRDP23468 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRDP23468 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRDP23468 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRDP23468 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRDP23468 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRDP23468 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRDP23468 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRDP23468 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRDP23468 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRDP23468 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRDP23468 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRDP23468 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRDP23468 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRDP23468 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRDP23468 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRDP23468 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRDP23468 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRDP23468 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRDP23468 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRDP23468 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRDP23468 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRDP23468 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRDP23468 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRDP23468 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PTPRDP23468 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRDP23468 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRDP23468 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRDP23468 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRDP23468 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRDP23468 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRDP23468 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRDP23468 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRDP23468 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRDP23468 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRDP23468 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRDP23468 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRDP23468 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRDP23468 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRDP23468 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
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