Protein–RNA interactions for Protein: P23458

JAK1, Tyrosine-protein kinase JAK1, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAK1P23458 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
JAK1P23458 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
JAK1P23458 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
JAK1P23458 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
JAK1P23458 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
JAK1P23458 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
JAK1P23458 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
JAK1P23458 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
JAK1P23458 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
JAK1P23458 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
JAK1P23458 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
JAK1P23458 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
JAK1P23458 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
JAK1P23458 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
JAK1P23458 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
JAK1P23458 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
JAK1P23458 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
JAK1P23458 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
JAK1P23458 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
JAK1P23458 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
JAK1P23458 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
JAK1P23458 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
JAK1P23458 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
JAK1P23458 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
JAK1P23458 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
JAK1P23458 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
JAK1P23458 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
JAK1P23458 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
JAK1P23458 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
JAK1P23458 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
JAK1P23458 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
JAK1P23458 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
JAK1P23458 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
JAK1P23458 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
JAK1P23458 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
JAK1P23458 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
JAK1P23458 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
JAK1P23458 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
JAK1P23458 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
JAK1P23458 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
JAK1P23458 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
JAK1P23458 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
JAK1P23458 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
JAK1P23458 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
JAK1P23458 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
JAK1P23458 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
JAK1P23458 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
JAK1P23458 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
JAK1P23458 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
JAK1P23458 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
JAK1P23458 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
JAK1P23458 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
JAK1P23458 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
JAK1P23458 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
JAK1P23458 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
JAK1P23458 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
JAK1P23458 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
JAK1P23458 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
JAK1P23458 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
JAK1P23458 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
JAK1P23458 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
JAK1P23458 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
JAK1P23458 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
JAK1P23458 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
JAK1P23458 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
JAK1P23458 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
JAK1P23458 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
JAK1P23458 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
JAK1P23458 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
JAK1P23458 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
JAK1P23458 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
JAK1P23458 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
JAK1P23458 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
JAK1P23458 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
JAK1P23458 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
JAK1P23458 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
JAK1P23458 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
JAK1P23458 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
JAK1P23458 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
JAK1P23458 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
JAK1P23458 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
JAK1P23458 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
JAK1P23458 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
JAK1P23458 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
JAK1P23458 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
JAK1P23458 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
JAK1P23458 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
JAK1P23458 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
JAK1P23458 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
JAK1P23458 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
JAK1P23458 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
JAK1P23458 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
JAK1P23458 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
JAK1P23458 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
JAK1P23458 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
JAK1P23458 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
JAK1P23458 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
JAK1P23458 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
JAK1P23458 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
JAK1P23458 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms