Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CXCL3P19876 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CXCL3P19876 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CXCL3P19876 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CXCL3P19876 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CXCL3P19876 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CXCL3P19876 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CXCL3P19876 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CXCL3P19876 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CXCL3P19876 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CXCL3P19876 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CXCL3P19876 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CXCL3P19876 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CXCL3P19876 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CXCL3P19876 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CXCL3P19876 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CXCL3P19876 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CXCL3P19876 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CXCL3P19876 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CXCL3P19876 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CXCL3P19876 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CXCL3P19876 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CXCL3P19876 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CXCL3P19876 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CXCL3P19876 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CXCL3P19876 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CXCL3P19876 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CXCL3P19876 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CXCL3P19876 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CXCL3P19876 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCL3P19876 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CXCL3P19876 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCL3P19876 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCL3P19876 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCL3P19876 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCL3P19876 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCL3P19876 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCL3P19876 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCL3P19876 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCL3P19876 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCL3P19876 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL3P19876 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL3P19876 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL3P19876 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL3P19876 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL3P19876 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL3P19876 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL3P19876 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL3P19876 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL3P19876 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL3P19876 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL3P19876 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL3P19876 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL3P19876 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms