Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TFE3P19532 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TFE3P19532 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TFE3P19532 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TFE3P19532 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TFE3P19532 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TFE3P19532 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TFE3P19532 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TFE3P19532 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TFE3P19532 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TFE3P19532 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TFE3P19532 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TFE3P19532 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TFE3P19532 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TFE3P19532 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TFE3P19532 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TFE3P19532 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TFE3P19532 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TFE3P19532 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TFE3P19532 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TFE3P19532 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TFE3P19532 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TFE3P19532 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TFE3P19532 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TFE3P19532 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TFE3P19532 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TFE3P19532 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TFE3P19532 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TFE3P19532 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TFE3P19532 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TFE3P19532 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TFE3P19532 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TFE3P19532 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TFE3P19532 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TFE3P19532 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TFE3P19532 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TFE3P19532 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TFE3P19532 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TFE3P19532 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TFE3P19532 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TFE3P19532 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TFE3P19532 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TFE3P19532 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TFE3P19532 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TFE3P19532 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TFE3P19532 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TFE3P19532 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TFE3P19532 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TFE3P19532 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TFE3P19532 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TFE3P19532 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TFE3P19532 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TFE3P19532 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TFE3P19532 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TFE3P19532 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TFE3P19532 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TFE3P19532 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TFE3P19532 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TFE3P19532 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TFE3P19532 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TFE3P19532 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TFE3P19532 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TFE3P19532 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TFE3P19532 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TFE3P19532 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TFE3P19532 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TFE3P19532 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TFE3P19532 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TFE3P19532 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TFE3P19532 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TFE3P19532 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TFE3P19532 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TFE3P19532 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TFE3P19532 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TFE3P19532 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TFE3P19532 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TFE3P19532 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TFE3P19532 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TFE3P19532 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TFE3P19532 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TFE3P19532 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TFE3P19532 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TFE3P19532 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TFE3P19532 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TFE3P19532 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TFE3P19532 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TFE3P19532 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TFE3P19532 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TFE3P19532 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TFE3P19532 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFE3P19532 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFE3P19532 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFE3P19532 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFE3P19532 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TFE3P19532 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TFE3P19532 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TFE3P19532 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TFE3P19532 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TFE3P19532 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFE3P19532 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms