Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNI1P19237 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNI1P19237 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNI1P19237 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNI1P19237 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNI1P19237 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNI1P19237 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNI1P19237 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNI1P19237 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNI1P19237 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNI1P19237 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNI1P19237 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNI1P19237 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNI1P19237 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNNI1P19237 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNNI1P19237 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNNI1P19237 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNNI1P19237 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNNI1P19237 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNI1P19237 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNI1P19237 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNI1P19237 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNI1P19237 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNI1P19237 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNI1P19237 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNI1P19237 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNI1P19237 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNI1P19237 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNI1P19237 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNI1P19237 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNI1P19237 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNI1P19237 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNI1P19237 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNI1P19237 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNI1P19237 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNI1P19237 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNI1P19237 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNI1P19237 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNI1P19237 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNI1P19237 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNI1P19237 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNI1P19237 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNI1P19237 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNNI1P19237 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNNI1P19237 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNNI1P19237 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNNI1P19237 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNNI1P19237 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TNNI1P19237 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNNI1P19237 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNNI1P19237 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNNI1P19237 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNNI1P19237 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNNI1P19237 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNI1P19237 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNI1P19237 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNI1P19237 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNI1P19237 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNI1P19237 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNI1P19237 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNI1P19237 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNNI1P19237 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNNI1P19237 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TNNI1P19237 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNNI1P19237 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNNI1P19237 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNNI1P19237 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNNI1P19237 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNNI1P19237 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNNI1P19237 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNNI1P19237 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNNI1P19237 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNNI1P19237 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNNI1P19237 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNNI1P19237 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNNI1P19237 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNNI1P19237 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNNI1P19237 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TNNI1P19237 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
TNNI1P19237 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNI1P19237 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNI1P19237 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNI1P19237 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNI1P19237 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNI1P19237 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNI1P19237 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNI1P19237 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNI1P19237 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNI1P19237 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNI1P19237 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNI1P19237 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNI1P19237 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNI1P19237 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNI1P19237 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNI1P19237 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNI1P19237 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNI1P19237 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNI1P19237 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNI1P19237 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNI1P19237 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms