Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PGAM1P18669 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGAM1P18669 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGAM1P18669 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGAM1P18669 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGAM1P18669 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGAM1P18669 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGAM1P18669 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PGAM1P18669 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGAM1P18669 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGAM1P18669 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGAM1P18669 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGAM1P18669 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGAM1P18669 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGAM1P18669 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGAM1P18669 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGAM1P18669 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGAM1P18669 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PGAM1P18669 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PGAM1P18669 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PGAM1P18669 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PGAM1P18669 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PGAM1P18669 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PGAM1P18669 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PGAM1P18669 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PGAM1P18669 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PGAM1P18669 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGAM1P18669 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGAM1P18669 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGAM1P18669 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGAM1P18669 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGAM1P18669 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGAM1P18669 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGAM1P18669 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGAM1P18669 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGAM1P18669 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGAM1P18669 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGAM1P18669 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGAM1P18669 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGAM1P18669 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGAM1P18669 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGAM1P18669 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGAM1P18669 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGAM1P18669 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGAM1P18669 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGAM1P18669 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGAM1P18669 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGAM1P18669 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGAM1P18669 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGAM1P18669 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGAM1P18669 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGAM1P18669 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGAM1P18669 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PGAM1P18669 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PGAM1P18669 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PGAM1P18669 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PGAM1P18669 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PGAM1P18669 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PGAM1P18669 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms