Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARF4P18085 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARF4P18085 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARF4P18085 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARF4P18085 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ARF4P18085 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARF4P18085 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARF4P18085 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARF4P18085 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARF4P18085 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARF4P18085 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARF4P18085 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARF4P18085 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ARF4P18085 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARF4P18085 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARF4P18085 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARF4P18085 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARF4P18085 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARF4P18085 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ARF4P18085 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARF4P18085 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARF4P18085 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARF4P18085 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARF4P18085 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ARF4P18085 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARF4P18085 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARF4P18085 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ARF4P18085 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARF4P18085 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ARF4P18085 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARF4P18085 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARF4P18085 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARF4P18085 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARF4P18085 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARF4P18085 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARF4P18085 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ARF4P18085 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARF4P18085 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARF4P18085 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARF4P18085 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARF4P18085 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARF4P18085 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARF4P18085 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARF4P18085 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARF4P18085 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARF4P18085 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARF4P18085 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARF4P18085 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARF4P18085 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARF4P18085 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARF4P18085 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARF4P18085 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARF4P18085 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARF4P18085 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARF4P18085 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARF4P18085 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARF4P18085 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARF4P18085 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARF4P18085 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ARF4P18085 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARF4P18085 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARF4P18085 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARF4P18085 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ARF4P18085 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ARF4P18085 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARF4P18085 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARF4P18085 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARF4P18085 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARF4P18085 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARF4P18085 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARF4P18085 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARF4P18085 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARF4P18085 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARF4P18085 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ARF4P18085 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARF4P18085 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ARF4P18085 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARF4P18085 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARF4P18085 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARF4P18085 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARF4P18085 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARF4P18085 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARF4P18085 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARF4P18085 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARF4P18085 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARF4P18085 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARF4P18085 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARF4P18085 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARF4P18085 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARF4P18085 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARF4P18085 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARF4P18085 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARF4P18085 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARF4P18085 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARF4P18085 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARF4P18085 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARF4P18085 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARF4P18085 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARF4P18085 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARF4P18085 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms