Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CTPS1P17812 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTPS1P17812 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTPS1P17812 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTPS1P17812 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTPS1P17812 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CTPS1P17812 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTPS1P17812 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CTPS1P17812 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTPS1P17812 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CTPS1P17812 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTPS1P17812 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTPS1P17812 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTPS1P17812 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTPS1P17812 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTPS1P17812 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTPS1P17812 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTPS1P17812 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTPS1P17812 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTPS1P17812 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTPS1P17812 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTPS1P17812 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTPS1P17812 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTPS1P17812 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTPS1P17812 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CTPS1P17812 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTPS1P17812 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTPS1P17812 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTPS1P17812 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTPS1P17812 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTPS1P17812 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTPS1P17812 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTPS1P17812 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CTPS1P17812 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTPS1P17812 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTPS1P17812 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTPS1P17812 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTPS1P17812 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTPS1P17812 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTPS1P17812 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTPS1P17812 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTPS1P17812 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTPS1P17812 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CTPS1P17812 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTPS1P17812 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTPS1P17812 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTPS1P17812 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTPS1P17812 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTPS1P17812 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTPS1P17812 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTPS1P17812 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTPS1P17812 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTPS1P17812 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTPS1P17812 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTPS1P17812 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTPS1P17812 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTPS1P17812 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTPS1P17812 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTPS1P17812 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTPS1P17812 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTPS1P17812 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTPS1P17812 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTPS1P17812 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTPS1P17812 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTPS1P17812 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTPS1P17812 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CTPS1P17812 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTPS1P17812 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTPS1P17812 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTPS1P17812 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTPS1P17812 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTPS1P17812 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTPS1P17812 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTPS1P17812 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTPS1P17812 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTPS1P17812 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTPS1P17812 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTPS1P17812 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTPS1P17812 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTPS1P17812 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTPS1P17812 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTPS1P17812 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTPS1P17812 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTPS1P17812 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTPS1P17812 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTPS1P17812 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTPS1P17812 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTPS1P17812 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTPS1P17812 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTPS1P17812 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTPS1P17812 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTPS1P17812 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTPS1P17812 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTPS1P17812 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTPS1P17812 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CTPS1P17812 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTPS1P17812 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTPS1P17812 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTPS1P17812 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTPS1P17812 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms