Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CREB1P16220 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CREB1P16220 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CREB1P16220 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CREB1P16220 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CREB1P16220 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CREB1P16220 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CREB1P16220 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CREB1P16220 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CREB1P16220 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CREB1P16220 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CREB1P16220 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CREB1P16220 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CREB1P16220 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CREB1P16220 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CREB1P16220 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CREB1P16220 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CREB1P16220 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CREB1P16220 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CREB1P16220 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CREB1P16220 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CREB1P16220 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CREB1P16220 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CREB1P16220 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CREB1P16220 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CREB1P16220 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CREB1P16220 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CREB1P16220 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CREB1P16220 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CREB1P16220 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CREB1P16220 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CREB1P16220 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CREB1P16220 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CREB1P16220 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CREB1P16220 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CREB1P16220 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CREB1P16220 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CREB1P16220 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB1P16220 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB1P16220 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB1P16220 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB1P16220 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB1P16220 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB1P16220 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB1P16220 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CREB1P16220 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CREB1P16220 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CREB1P16220 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CREB1P16220 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CREB1P16220 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREB1P16220 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CREB1P16220 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREB1P16220 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREB1P16220 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREB1P16220 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CREB1P16220 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CREB1P16220 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREB1P16220 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREB1P16220 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREB1P16220 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CREB1P16220 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CREB1P16220 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CREB1P16220 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CREB1P16220 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CREB1P16220 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREB1P16220 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREB1P16220 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREB1P16220 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREB1P16220 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREB1P16220 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREB1P16220 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CREB1P16220 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CREB1P16220 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CREB1P16220 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CREB1P16220 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CREB1P16220 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CREB1P16220 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CREB1P16220 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CREB1P16220 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CREB1P16220 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CREB1P16220 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CREB1P16220 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CREB1P16220 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CREB1P16220 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CREB1P16220 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CREB1P16220 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CREB1P16220 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CREB1P16220 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CREB1P16220 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CREB1P16220 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CREB1P16220 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CREB1P16220 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CREB1P16220 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CREB1P16220 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CREB1P16220 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CREB1P16220 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CREB1P16220 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREB1P16220 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREB1P16220 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREB1P16220 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms