Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCG2P13521 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCG2P13521 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCG2P13521 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCG2P13521 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCG2P13521 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCG2P13521 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCG2P13521 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SCG2P13521 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCG2P13521 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCG2P13521 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCG2P13521 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCG2P13521 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCG2P13521 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCG2P13521 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCG2P13521 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCG2P13521 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCG2P13521 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCG2P13521 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCG2P13521 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCG2P13521 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCG2P13521 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCG2P13521 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCG2P13521 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCG2P13521 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCG2P13521 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCG2P13521 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCG2P13521 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SCG2P13521 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCG2P13521 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SCG2P13521 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCG2P13521 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCG2P13521 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCG2P13521 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCG2P13521 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCG2P13521 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCG2P13521 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCG2P13521 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCG2P13521 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCG2P13521 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCG2P13521 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCG2P13521 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCG2P13521 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCG2P13521 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCG2P13521 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCG2P13521 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SCG2P13521 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCG2P13521 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCG2P13521 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCG2P13521 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCG2P13521 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCG2P13521 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCG2P13521 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCG2P13521 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCG2P13521 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCG2P13521 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCG2P13521 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCG2P13521 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCG2P13521 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCG2P13521 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCG2P13521 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCG2P13521 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCG2P13521 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCG2P13521 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCG2P13521 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCG2P13521 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCG2P13521 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCG2P13521 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCG2P13521 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCG2P13521 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCG2P13521 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCG2P13521 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCG2P13521 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCG2P13521 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCG2P13521 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCG2P13521 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCG2P13521 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCG2P13521 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCG2P13521 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCG2P13521 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCG2P13521 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SCG2P13521 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCG2P13521 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCG2P13521 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCG2P13521 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCG2P13521 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCG2P13521 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCG2P13521 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCG2P13521 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCG2P13521 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCG2P13521 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCG2P13521 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCG2P13521 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCG2P13521 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCG2P13521 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCG2P13521 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SCG2P13521 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCG2P13521 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCG2P13521 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCG2P13521 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms