Protein–RNA interactions for Protein: P12829

MYL4, Myosin light chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL4P12829 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MYL4P12829 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MYL4P12829 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYL4P12829 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYL4P12829 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYL4P12829 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYL4P12829 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYL4P12829 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYL4P12829 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYL4P12829 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYL4P12829 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYL4P12829 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYL4P12829 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYL4P12829 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYL4P12829 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYL4P12829 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYL4P12829 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYL4P12829 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYL4P12829 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYL4P12829 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYL4P12829 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYL4P12829 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYL4P12829 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYL4P12829 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYL4P12829 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYL4P12829 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYL4P12829 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYL4P12829 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYL4P12829 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYL4P12829 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYL4P12829 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MYL4P12829 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MYL4P12829 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MYL4P12829 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MYL4P12829 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MYL4P12829 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MYL4P12829 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYL4P12829 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYL4P12829 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYL4P12829 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MYL4P12829 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYL4P12829 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYL4P12829 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYL4P12829 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYL4P12829 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYL4P12829 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYL4P12829 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYL4P12829 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYL4P12829 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYL4P12829 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYL4P12829 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYL4P12829 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MYL4P12829 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYL4P12829 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYL4P12829 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYL4P12829 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYL4P12829 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYL4P12829 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYL4P12829 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYL4P12829 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYL4P12829 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYL4P12829 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYL4P12829 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYL4P12829 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYL4P12829 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYL4P12829 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MYL4P12829 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYL4P12829 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYL4P12829 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYL4P12829 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MYL4P12829 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYL4P12829 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYL4P12829 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYL4P12829 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYL4P12829 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MYL4P12829 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYL4P12829 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYL4P12829 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYL4P12829 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYL4P12829 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYL4P12829 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYL4P12829 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYL4P12829 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYL4P12829 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYL4P12829 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYL4P12829 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MYL4P12829 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYL4P12829 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYL4P12829 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYL4P12829 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYL4P12829 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYL4P12829 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYL4P12829 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYL4P12829 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYL4P12829 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYL4P12829 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYL4P12829 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYL4P12829 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYL4P12829 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MYL4P12829 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms