Protein–RNA interactions for Protein: P11171

EPB41, Protein 4.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41P11171 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EPB41P11171 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EPB41P11171 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EPB41P11171 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EPB41P11171 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EPB41P11171 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EPB41P11171 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EPB41P11171 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EPB41P11171 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EPB41P11171 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EPB41P11171 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EPB41P11171 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EPB41P11171 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPB41P11171 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPB41P11171 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPB41P11171 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPB41P11171 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EPB41P11171 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EPB41P11171 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EPB41P11171 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EPB41P11171 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EPB41P11171 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EPB41P11171 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EPB41P11171 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EPB41P11171 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EPB41P11171 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EPB41P11171 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
EPB41P11171 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EPB41P11171 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EPB41P11171 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EPB41P11171 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
EPB41P11171 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EPB41P11171 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EPB41P11171 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EPB41P11171 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EPB41P11171 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EPB41P11171 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
EPB41P11171 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EPB41P11171 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EPB41P11171 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EPB41P11171 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EPB41P11171 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EPB41P11171 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EPB41P11171 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EPB41P11171 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EPB41P11171 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EPB41P11171 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EPB41P11171 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EPB41P11171 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EPB41P11171 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EPB41P11171 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EPB41P11171 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EPB41P11171 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EPB41P11171 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EPB41P11171 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EPB41P11171 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EPB41P11171 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EPB41P11171 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPB41P11171 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPB41P11171 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPB41P11171 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPB41P11171 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPB41P11171 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPB41P11171 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPB41P11171 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPB41P11171 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPB41P11171 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPB41P11171 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPB41P11171 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPB41P11171 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPB41P11171 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
EPB41P11171 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EPB41P11171 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EPB41P11171 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EPB41P11171 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EPB41P11171 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EPB41P11171 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
EPB41P11171 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPB41P11171 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPB41P11171 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPB41P11171 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
EPB41P11171 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPB41P11171 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPB41P11171 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPB41P11171 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
EPB41P11171 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPB41P11171 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPB41P11171 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPB41P11171 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPB41P11171 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPB41P11171 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPB41P11171 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPB41P11171 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPB41P11171 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPB41P11171 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPB41P11171 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPB41P11171 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPB41P11171 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPB41P11171 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPB41P11171 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms